科学家如何使用 Claude 加速研究与发现¶
Anthropic 展示了三个前沿实验室如何将 Claude 从文献综述和编程助手升级为全流程科研协作者——斯坦福 Biomni 将数月的全基因组关联研究压缩到 20 分钟,MIT Cheeseman 实验室自动化了数千基因敲除实验的解读,斯坦福 Lundberg 实验室正测试 AI 引导的假设生成。
背景¶
Anthropic 于 2025 年 10 月推出了 Claude for Life Sciences——一套连接器和技能,旨在让 Claude 成为更好的科学协作者。此后,团队持续投入使 Claude 成为科研领域最强大的模型,Opus 4.5 在图表解读、计算生物学和蛋白质理解基准测试中展现了显著进步。
AI for Science 项目为全球从事高影响力科研项目的顶尖研究人员提供免费 API 额度。
研究人员开发的定制系统已超越文献综述或编程辅助的范畴。Claude 作为"跨研究全流程的协作者"发挥作用。
Biomni:通用生物医学智能体¶
斯坦福大学 Biomni 平台将数百种工具、软件包和数据集整合到单一系统中,由 Claude 驱动的智能体在超过 25 个生物学子领域中自主导航、形成假设、设计实验方案并执行分析。
工作原理¶
研究者用自然语言提出请求,Biomni 自动选择合适的资源。它能够形成假设、设计实验方案,并在超过 25 个生物学子领域中执行分析。
基因组关联研究(GWAS)示例¶
以绝对音感为例——这是一种有遗传基础的特征。在 Biomni 的早期试验中,通常需要数月才能完成的全基因组关联研究在 20 分钟内完成。
验证研究¶
根据预印本论文的验证结果:
| 验证场景 | 结果 |
|---|---|
| 分子克隆实验设计 | 盲评中方案与 5 年以上经验博士后的设计匹配 |
| 可穿戴设备数据分析(450+ 文件,30 人,含连续血糖、体温、体力活动) | 35 分钟完成,人类专家预估需 3 周 |
| 人类胚胎组织单细胞基因活性分析(336,000+ 细胞) | 确认已知调控关系并发现此前未关联到人类胚胎发育的新转录因子 |
安全护栏与技能系统¶
Biomni 包含护栏机制来检测 Claude 是否偏离正轨。专家可以将方法论编码为技能(skill)。在与"未确诊疾病网络"合作进行罕见病诊断时,团队采访了一位专家,逐步记录其诊断流程,然后将其教给 Claude。
Cheeseman 实验室:自动化大规模基因敲除实验的解读¶
MIT/Whitehead 研究所的 Cheeseman 实验室使用 CRISPR 敲除数千个基因,用 Claude 驱动的 MozzareLLM 系统自动化了此前需要数百小时人工解读的模式识别工作。
实验流程¶
Iain Cheeseman 的实验室使用 CRISPR 在数千万人类细胞中敲除数千个基因,然后对每个细胞拍照。他们构建了名为 Brieflow(取自布里奶酪)的流水线来自动检测模式和基因分组。
瓶颈¶
解读基因分组的含义仍需人类专家。Cheeseman 估计他能回忆起约 5,000 个基因的功能,但有效分析数据仍需数百小时。
解决方案:MozzareLLM¶
博士生 Matteo Di Bernardo 构建了 MozzareLLM——一个 Claude 驱动的系统,自动化了 Cheeseman 的解读方法。
Iain Cheeseman: "每次我查看结果都会说,'我没注意到那个!'而每个案例都是我们能理解和验证的发现。"
核心能力¶
- 识别基因簇中的共同生物学过程
- 标记研究充分与研究不足的基因
- 突出值得跟进的基因
- 提供发现的置信度水平
性能表现¶
在多模型测试中,Claude 表现优于其他方案——有一个案例中 Claude 正确识别出一条 RNA 修饰通路,而其他模型将其视为随机噪音而忽略。
未来愿景¶
将 Claude 注释的数据集公开,让其他领域的专家能够跟进被标记的基因簇。
Lundberg 实验室:测试 AI 引导的假设生成¶
斯坦福 Lundberg 实验室构建了一套系统,让 Claude 基于分子属性和关系图谱来选择研究目标,而非依赖传统的文献驱动"有根据的猜测"——单次聚焦筛选成本超过 2 万美元,选错目标代价高昂。
问题¶
单次聚焦筛选成本高达 20,000 美元以上。实验室通常用 Google 电子表格进行"有根据的猜测"来选择几百个基因——受限于人力带宽。
方法¶
团队构建了细胞中每个已知分子及其相互关系的图谱,让 Claude 基于生物学属性和分子关系在图谱中导航,识别候选基因——不是问"从现有文献能做什么猜测",而是问"基于分子属性应该研究什么"。
当前实验¶
他们选择初级纤毛(一种天线样附属结构,与发育和神经系统疾病相关)作为测试案例,因为相关研究很少。他们将进行全基因组筛选建立基准真相,然后比较:
- 人类专家(电子表格方法) vs. Claude(分子关系图谱方法)
假设性示例:如果 Claude 在 200 个基因中捕获 150 个,而人类捕获 80 个,就证明该方法更优。
关键数据汇总¶
| 指标 | 数据 |
|---|---|
| GWAS 完成时间(Biomni) | 20 分钟 vs. 数月 |
| 可穿戴设备数据分析(Biomni) | 35 分钟 vs. 3 周 |
| 胚胎组织分析细胞数 | 336,000+ |
| 可穿戴数据文件数 | 450+(30 人) |
| Cheeseman 能回忆的基因数 | ~5,000 |
| 单次聚焦筛选成本 | $20,000+ |
| Biomni 覆盖的生物学子领域 | 25+ |
展望¶
各实验室的共同发现:AI 工具的效用随模型能力增长而增长。两年前模型只能写代码或总结论文,如今更强大的智能体已开始复现论文中描述的研究本身。
每次模型发布都带来显著改进。研究人员自建的定制系统已远超简单的文献综述或编码辅助——Claude 正在成为贯穿研究全流程的真正协作者。
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